发表日期：2020-02-18

作者：Juan Angel Patino-Galindo, Ioan Filip, Mohammed AlQuraishi, ProfileRaul Rabadan

主要内容：在中国武汉爆发的一种新的冠状病毒（2019-nCoV）突显了需要了解驱动人类中人畜共患病毒出现和适应的进化过程。在这里，我们显示β-冠状病毒中的重组，包括SARS和MERS等人类感染病毒，经常包含Spike基因中的受体结合域（RBD）。我们发现，这种共同过程可能导致至少11年前在涉及RBD的2019-nCoV的祖先中发生了重组事件。与蝙蝠分离物相比，2019-nCoV的最近祖先在RBD中以及在对病毒复制和转录至关重要的多蛋白Orf1a区域中积累了大量氨基酸取代。在这些最近的突变中，我们确定了SARS 2003爆发分离株在位置427N和436Y中共有的氨基酸取代，表明潜在的适应性收敛进化。 427N和436Y均属于似乎与人ACE2受体相互作用的螺旋。总之，我们提出了2019-nCoV病毒出现的两次打击方案，即蝙蝠中的2019-nCoV祖先通过在2009年之前通过重组整合SARS样RBD来获得SARS的遗传特征，然后重组体经历了趋同进化。

文章链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.10.942748v1